Ingon nga ang Tomato Brown Rugose Fruit Virus nakaapekto sa mga tanum nga kamatis ug sili sa tibuuk kalibutan, ang mga kompanya sa binhi nagtrabaho sa pagpasanay sa usa ka resistensya nga kamatis.
Ang adunahan nga genetic ug genomic nga mga kapanguhaan anaa na sa mga tigpasanay sa kamatis bisan sa wala pa ang pagsugod sa genomic sequencing nga mga proyekto sa kamatis. Ang dagkong mga koleksyon sa germplasm sa kamatis dugay na nga natukod sa daghang mga lokasyon. Kapin sa 75,000 ka tomato accession ang gitipigan sa mga genebank sa tibuok kalibutan. Usa sa pinakadako mao ang USDA genebank sa Geneva, NY.
Ang pagkasunodsunod sa genome sa kamatis gisugdan niadtong 2005 isip usa ka multinasyunal nga paningkamot tali sa 14 ka nasod ug nahuman niadtong 2012. Kini nga mga paningkamot gipaspasan pag-ayo sa paggamit sa artipisyal nga paniktik, pagkat-on sa makina ug mga advanced algorithm sa pag-analisar sa daghang gidaghanon sa genetic ug phenotypic nga datos.
Tomato Pan-Genome
Ang mga tigdukiduki gikan sa Boyce Thompson Institute kaniadtong 2020 nagmugna usa ka taas nga kalidad nga reference genome alang sa mga ihalas nga kamatis aron makahimo usa ka labi ka kompleto ug mapuslanon nga pan-genome sa kamatis. Nadiskobrehan nila ang mga seksyon sa genome nga nagpailalom sa lami sa prutas, gidak-on ug pagkahinog, pag-agwanta sa stress ug pagsukol sa sakit. Salamat sa usa ka bahin sa mga teknolohiya sa pagsunud-sunod nga mga teknolohiya nga makabasa sa taas kaayo nga mga piraso sa DNA, ang reference genome mas kompleto ug tukma kaysa sa naglungtad nga database.
Ang mas karaan nga mga teknolohiya sa pagsunud-sunod nga nagbasa sa mas mugbo nga mga piraso sa DNA nagpaila sa mga mutasyon sa lebel sa usa ka base. Bisan pa, dili sila maayo sa pagpangita sa mga variant sa istruktura sama sa pagsal-ot, pagtangtang, pagbag-o o pagdoble sa dagkong mga tipak sa DNA.
Sa 2019, usa ka internasyonal nga grupo sa mga tigdukiduki nagtukod usa ka tomato pan-genome gamit ang genome sequence gikan sa 725 nga phylogenetically ug geographically representative nga mga lahi. Kini nga database naglakip sa 4,873 ka mga gene nga wala makita sa orihinal nga reference genome. Ang present/absent variation analysis nagpadayag sa dakong pagkawala sa gene ug grabe nga negatibong pagpili sa mga gene ug promoter atol sa pagpamuhi ug pagpaayo sa kamatis.
Basaha ang kompletong artikulo sa www.seedworld.com.